En la temporada 1998/99, con Vicente González Villamil en el banquillo, el equipo comienza dubitativo y de nuevo Félix Arnáiz Lucas se hace cargo del equipo desde la jornada 9. El equipo mejora ostensiblemente y acaba 4.º, jugando finalmente la fase de ascenso a Segunda División, consistente en una liguilla con otros tres equipos más. Aurélien Tchouaméni fue fichado en el verano de 2022 procedente del Mónaco como una apuesta del club blanco para que dirigiese la medular durante los siguientes años.