Motagua es el club hondureño que más jugadores ha aportado a la selección hondureña en Copas del Mundo -11 jugadores en total-. El jugador motagüense Héctor Zelaya convirtió el primer gol hondureño en una Copa del Mundo, durante la edición de España 1982. En aquella justa mundialista, la selección hondureña se nutrió con cuatro jugadores motagüenses: Ramón Maradiaga, David Bueso, Héctor Zelaya y José Luis Cruz. Así, en la edición de Sudáfrica 2010, la selección hondureña contó con cinco jugadores motagüenses dentro de su convocatoria: Ricardo Canales, Amado Guevara, Emilio Izaguirre, Sergio Mendoza y Georgie Welcome.